@MSGID:
<ac4c0f47-656f-41f9-8708-c165138e1572n@googlegroups.com> b457245f
@REPLY:
<266196f1-532d-4b05-9d8b-762007dc94edn@googlegroups.com> 954160b4
@REPLYADDR Gary Hurd <garyhurd@cox.net>
@REPLYTO 2:5075/128 Gary Hurd
@CHRS: CP866 2
@RFC: 1 0
@RFC-Message-ID:
<ac4c0f47-656f-41f9-8708-c165138e1572n@googlegroups.com>
@RFC-References:
<172b9573-e445-4bf3-82bd-75a838736baan@googlegroups.com> <266196f1-532d-4b05-9d8b-762007dc94edn@googlegroups.com>
@TZUTC: -0700
@PID: G2/1.0
@TID: FIDOGATE-5.12-ge4e8b94
On Tuesday, September 26, 2023 at 4:30:49 PM UTC-7, MarkE wrote:
> On Wednesday, September 27, 2023 at 12:10:49 AM UTC+10, MarkE wrote: 
 > > The title is "A new model for the origin of life: A new
model for the origin of life: Coupled phases and combinatorial selection
in fluctuating hydrothermal pools." 
> > https://youtu.be/nk R55O24t4?feature=shared 
> > 
 > > Summary: "Hydrothermal fields on the prebiotic Earth are
candidate environments for biogenesis. We propose a model in which molecular
systems driven by cycles of hydration and dehydration in such sites undergo
chemical evolution and selection in a dehydrated surface phase followed by
encapsulation and combinatorial selection in a hydrated phase. This model is
partly supported by recent science, and lies partly in the realm of
speculation including a hypothesized pathway for the parallel evolution of the
functional machinery of life. Complex models like this present challenges for
science in the 21st century and we will describe a new technology to
enable the simulation of such models." 
> > 
 > > I say "excellent presentation" because it is a well-explained
overview of a model these leading OoL researchers have collaborated
extensively on. Commendably, their approach attempts to resolve the "water
paradox" with cycles of hydration and dehydration, the salt problem using
freshwater hydrothermal pools, it seeks a systems chemistry approach moving
reactions away from equilibrium, and urges getting out of glasswear and into
prebiotically plausible natural environments. 
> > 
 > > THIS I BELIEVE IS ONE OF THE MOST RECENT AND BEST HOLISTIC
OOL MODELS ON OFFER, FROM LEADERS IN THE FIELD. 
> > 
> > Some observations and comments. 
> > 
 > > * 3:51 Off the bat Damer asked the question, "Why does the
community need a new model for the origin of life?" 
> > 
 > > He then answers in a way remarkably similar to criticisms by
James Tour and William Bains. 
> > 
 > > * 6:51 "Freeman Dyson who I confer with what about once a
year on this project, and he kind of gives us a thumbs up, in general
had this idea that life began with little bags of garbage and these
are lipid bags in solution the garbage is the dirty water that is the
random chemical compound components, and that somehow this dirty water
started to do metabolism and that it could replicate its contents and then
the bags would grow and split in two, and if they split in two now
quickly enough and reliably enough, you`d have life, but that`s a you know
it sounds a little kind of flippant, but in fact this is a very
profound insight as to how life may have started..." 
> > 
> > See: https://groups.google.com/g/talk.origins/c/Ki5fLxziHos/m/QeqGRxj2AQAJ 
> > 
 > > * 11:54 "so here we have a sort of putative environment for
what we`re talking about. You`ll notice that there`s sort of this slurry
here that sort of represents the fact that perhaps this pool dried down
many times and it`s rehydrated many times and it turns out when this
happens that things are deposited on the edge of the pool think of them
like think of this like a bathtub ring in your bathtub..." 
> > 
 > > Displayed is a photo of pool with chemical deposits visible
from changing water levels. Kudos for proposing a process and locating it
in prebiotically plausible natural environment. 
> > 
 > > How/where from the supply of free lipids and nucleotides and/or
amino acids? 
 > > Dilution of these monomers in the pool a problem, despite the
drying-concentrating effect. 
> > No mention of a mechanism for chirality necessity. 
> > 
 > > But an interesting and innovative scenario all the same. It
does offer a stepwise pathway for pre-biotic evolution. 
> > 
 > > * 19:54 "I think there`s two dozen volcanoes on Kamchatka; I
think there`s several hundred hydrothermal systems the size of Yellowstone
on Kamchatka, it`s just an enormous system so on the early Earth the
hydrothermal field attached you know on a volcanic island would have been one
of the most chemically rich and dynamic environments." 
> > 
 > > Arguing against myself for a moment: it would be easy to
under-appreciate that you get to roll the dice an incomprehensibly large number of
times. 
> > 
 > > * 23:48 "let`s look at here`s our a primitive protocell on
the way to life in our system that has as we mentioned before pores
it has a membrane of course it has something that`s stabilizing the
membrane something like a primitive cytoskeleton it has the beginnings of a
metabolic system it has the beginnings of replicator and in all of this it
has to have some kind of emergent feedback mechanism that controls the
rates of everything because as soon as you get a chemical reaction that
goes around and generates products it can get out of control you need
to have a regulatory mechanism that controls those rates..." 
> > 
 > > All that from recycled little bags of garbage. But I accept
it`s a hypothesis ready for testing. Let the empirical verification begin.

> > 
 > > * 27:29 "...when the proto cell is able to do the trick of
dividing its contents dividing itself and creating daughter cells" 
> > 
 > > Usefully accurate and repeatable cell division that duplicates
and separates the protocell`s polymers prior to pinching and splitting?
Wow. 
> > 
 > > * 49:16 "with one of our instruments here`s how we test the
hypothesis. we`re going to make an anaerobic condition we just chose carbon
dioxide we could use others if we wished such as nitrogen for example but
we cannot have oxygen there that these temperatures oxygen begins to
attack the molecules we want to have an anaerobic environment..." 
> > 
> > Credit for the experimental commitment. Let`s see what emerges.
 > This talk is from 2015, though David Deamer`s book "Assembling
Life" that is based on this was published in 2019. Note Bruce Damer`s
call for a new approach to OoL, and note the uncanny alignment with
Tour, Bains, Long Story Short, etc: 
> 
 > 4:29 "[OoL research has] been mainly focused on individual
solution chemistry experiments where they want to show polymerization over
here, or they want to show metabolism over here, and Dave and I believe
that it`s time for the field to go from incremental progress to
substantial progress. So, these are the four points we`ve come up with to make
substantial progress in the origin of life, and the first one is to employ
something called system chemistry, having sufficient complexity so instead of
one experiment say about proteins, now you have an experiment about the
encapsulation of proteins for example, and informational molecules built from
nucleotides in an environment that would say be like an analog of the early
Earth, build a complex experiment. Something we`re calling sufficient
complexity, and all of these experiments have to move the reactions away from
equilibrium. And what do we mean by that? Well, in in your high school
chemistry experiments, something starts foaming something changes color and then
the experiment winds down and stops. Well, life didn`t get started that
way. Life got started by a continuous run-up of complexity and building
upon in a sense nature as a ratchet. So we have to figure out how to
build experiments that move will move away from equilibrium..." 
> 
 > 6:31 "You can`t sit in a laboratory just using glassware. You
have to go to the field. You have to go to hot springs, you have to
go to [...] Iceland and come check and sit down and see what the
natural environment is like, rather than being in the ethereal world of
pure reactants and things like that..."


Deamer`s current work has focused on hot springs including lab and field work.

--- G2/1.0
 * Origin: University of Ediacara (2:5075/128)
SEEN-BY: 5001/100 5005/49 5015/255 5019/40 5020/715
848 1042 4441 12000
SEEN-BY: 5030/49 1081 5058/104 5075/128
@PATH: 5075/128 5020/1042 4441